No sé como funciona el código que estás usando, pero lo normal sería que acabase llamando a la función login de Joomla, que a su vez dispara los eventos, pero puede que ese no sea el caso.
Tendrías que ver si $cbAuthenticate->login acaba disparando los eventos o no.
Lo que yo haría primero es quitar los trigger que has puesto tu, y tocar el joomdlehooks plugin para que haga un echo y un exit si se ejecuta sus funciones onUserLogin, onUserAfterLogin.
De este modo sabes si se está disparando.
Si no se dispara entonces tendrías que dispararlos tu como estás probando, pero tampoco te puedo dar mucha más indicación, ya que nunca he hecho un sistema de login separado de Joomla.
